FluoroFinder

Flow Cytometry Spectral Analyzer Western Blot Microscopy

Spectral Viewer

Instrument

Fluorophores

'*' Fluorophores are theoretical Show theoretical data


Fluorophore

Remove all Fluorophores

Similarity Matrix

	Alexa Fluor 555	Alexa Fluor 488	mCherry	E2-Crimson *	Cy5	CellTrace Violet *	eGFP	APC	Alexa Fluor 700	Brilliant Violet 421	Brilliant Violet 605 *	Brilliant Violet 650	PE	FITC
Alexa Fluor 555	1.0	0.61	0.57	0.02	0.0		0.49	0.01	0.0	0.29	0.62	0.02	0.81	0.64
Alexa Fluor 488	0.61	1.0	0.06	0.0	0.0		0.93	0.0	0.0	0.71	0.07	0.0	0.15	1.0
mCherry	0.57	0.06	1.0	0.05	0.0		0.02	0.02	0.01		0.85	0.06	0.41	0.07
E2-Crimson *	0.02	0.0	0.05	1.0	0.95		0.0	0.98	0.36	0.0	0.03	0.96	0.01	0.0
Cy5	0.0	0.0	0.0	0.95	1.0		0.0	0.89	0.22	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0
CellTrace Violet *						1.0
eGFP	0.49	0.93	0.02	0.0	0.0		1.0	0.0	0.0	0.91	0.03	0.0	0.07	0.93
APC	0.01	0.0	0.02	0.98	0.89		0.0	1.0	0.52	0.0	0.01	0.98	0.0	0.0
Alexa Fluor 700	0.0	0.0	0.01	0.36	0.22		0.0	0.52	1.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0
Brilliant Violet 421	0.29	0.71		0.0	0.0		0.91	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.7
Brilliant Violet 605 *	0.62	0.07	0.85	0.03	0.0		0.03	0.01	0.0	0.0	1.0	0.04	0.57	0.1
Brilliant Violet 650	0.02	0.0	0.06	0.96	0.84		0.0	0.98	0.54	0.0	0.04	1.0	0.01	0.0
PE	0.81	0.15	0.41	0.01	0.0		0.07	0.0	0.0	0.0	0.57	0.01	1.0	0.18
FITC	0.64	1.0	0.07	0.0	0.0		0.93	0.0	0.0	0.7	0.1	0.0	0.18	1.0

7-AAD	0.32		0.79								0.65	0.13	0.18
Alexa Fluor 532	0.87	0.52	0.34				0.32				0.45		0.67	0.55
Alexa Fluor 546	0.81	0.14	0.44								0.62		0.99	0.17
Alexa Fluor 561	0.86	0.17	0.57								0.7		0.98	0.2
Alexa Fluor 647								0.95	0.54			0.97
Alexa Fluor 660								0.72	0.83			0.8
Alexa Fluor 680								0.63	0.89			0.72
Alexa Fluor 750								0.26	0.41			0.26
Alexa Fluor 790								0.12	0.25			0.12
AmCyan	0.52	0.95					1.0							0.94
APC-Alexa 700								0.55	1.0			0.57
APC-Alexa 750								0.26	0.38			0.25
APC-Cy5.5								0.7	0.82			0.79
APC-Cy7								0.19	0.36			0.18
APC-eFluor 780								0.21	0.35			0.21
APC-Fire 750								0.17	0.33			0.16
APC-Fire 810								0.13	0.22			0.14
APC-H7								0.15	0.32			0.15
APC-R700								0.59	0.97			0.65
APC-Vio770								0.21	0.37			0.2
BB515	0.56	0.98					0.98						0.11	0.98
BB630-P	0.58		0.96								0.92		0.43
BB660-P	0.24		0.61					0.53	0.27		0.51	0.58	0.13
BB700	0.19		0.5					0.33	0.36		0.34	0.41
BB755-P	0.17		0.27						0.12		0.19		0.11
BB790-P			0.14
Brilliant Violet 570	0.84	0.14	0.59								0.72		0.98	0.17
Brilliant Violet 711								0.56	0.97			0.61
Brilliant Violet 750								0.28	0.59			0.23
Brilliant Violet 785								0.17	0.37			0.16
Brilliant Violet 786								0.19	0.4			0.17
BUV661								0.98	0.56			1.0
BUV737								0.41	0.85			0.38
BUV805									0.22
BYG584-P	0.83	0.14	0.58								0.74		0.96	0.17
Calcein Green	0.55	0.98					0.99						0.11	0.97
CellTrace Far Red								0.99	0.52			0.99
CellTracker Green	0.66	0.99					0.88				0.12		0.2	0.99
CF450	0.77	0.96	0.2				0.91				0.25		0.33	0.97
CF488A	0.57	0.99					0.97						0.12	0.99
CF514	0.8	0.68	0.27				0.46				0.34		0.45	0.71
CF532	0.9	0.48	0.41				0.29				0.52		0.73	0.52
CF543	0.89	0.26	0.46				0.14				0.62		0.97	0.29
CF555	0.87	0.19	0.59								0.71		0.97	0.22
CF568	0.83	0.14	0.58								0.74		0.96	0.17
CF570	0.83	0.13	0.68								0.82		0.92	0.16
CF583	0.67		0.93								0.99		0.57
CF594	0.53		0.97					0.18			0.9	0.23	0.37
CF633								0.99	0.62			0.99
CF640R								0.99	0.55			0.98
CF647								0.95	0.54			0.98
CF660C								0.8	0.66			0.87
CF660R								0.8	0.67			0.88
CF680								0.64	0.86			0.73
CF680R								0.63	0.88			0.72
CF700								0.51	0.99			0.54
CF750								0.16	0.33			0.15
CF770								0.12	0.27			0.13
cFluor B515	0.57	0.99					0.97						0.12	0.99
cFluor B532	0.65	0.96					0.79						0.19	0.96
cFluor B548	0.8	0.68	0.27				0.46				0.34		0.45	0.71
cFluor B690	0.16		0.51					0.28	0.3		0.36	0.35
cFluor BYG575	0.81	0.15	0.41								0.57		1.0	0.18
cFluor BYG610	0.71		0.91								0.95		0.64	0.12
cFluor BYG667	0.24		0.63					0.38	0.21		0.51	0.45	0.14
cFluor BYG680	0.2		0.53					0.4	0.34		0.39	0.48	0.11
cFluor BYG710	0.15		0.36					0.18	0.33		0.27	0.22
cFluor BYG781
cFluor R659								1.0	0.52			0.98
cFluor R668								0.95	0.54			0.98
cFluor R685								0.8	0.66			0.87
cFluor R720								0.51	0.99			0.54
cFluor R780								0.17	0.33			0.16
cFluor R840								0.13	0.22			0.14
cFluor YG584	0.83	0.14	0.58								0.74		0.96	0.17
cFluor YG610	0.62		0.96								0.96		0.49
CFP	0.55	0.92					0.99						0.15	0.92
CFSE	0.63	1.0					0.94						0.17	1.0
DRAQ 5								0.67	0.86			0.71
DRAQ 7								0.64	0.87			0.69
dsRed	0.87	0.22	0.74				0.15				0.87		0.88	0.25
DsRed Express	0.85	0.17	0.78								0.89		0.88	0.2
DyLight 550	0.86	0.16	0.57								0.7		0.98	0.2
DyLight 650								0.91	0.67			0.95
DyLight 800									0.23			0.11
ECD	0.59		0.97								0.92		0.46
eFluor 520 Fix Viability	0.75	0.94	0.15				0.78				0.2		0.31	0.95
eFluor 570	0.86	0.17	0.57								0.7		0.98	0.2
eFluor 615	0.52		0.91					0.4	0.24		0.83	0.45	0.39
eFluor 660								0.94	0.56			0.97
eFluor 780 Fix Viability								0.16	0.33			0.15
eYFP	0.67	0.86					0.64				0.13		0.24	0.87
FVS520	0.68	0.96					0.83						0.23	0.97
FVS620	0.6		0.96								0.9		0.48
FVS660								0.96	0.51			0.98
FVS700								0.67	0.89			0.75
FVS780								0.17	0.34			0.16
GFP	0.56	0.98					0.98						0.12	0.98
Ghost Dye Blue 516	0.62	1.0					0.91						0.15	1.0
Ghost Dye Red 710								0.61	0.96			0.68
Ghost Dye Red 780								0.14	0.32			0.14
Janelia Fluor 646								0.93	0.5			0.96
KIRAVIA Blue 520	0.66	0.99					0.89				0.12		0.2	1.0
Live/Dead Fix Far Red								0.95	0.52			0.97
Live/Dead Fix Green	0.72	0.95	0.12				0.79				0.16		0.27	0.96
Live/Dead Fix Near IR (775)								0.16	0.34			0.16
Live/Dead Fix Red	0.61		0.94					0.18			0.93	0.22	0.48
Live-or-Dye 488/515	0.57	0.99					0.97						0.12	0.99
Live-or-Dye 510/550	0.8	0.68	0.27				0.46				0.34		0.45	0.71
Live-or-Dye 568/583	0.83	0.14	0.58								0.74		0.96	0.17
Live-or-Dye 594/614	0.53		0.97					0.18			0.9	0.23	0.37
Live-or-Dye 640/662								0.99	0.55			0.98
Live-or-Dye 665/685								0.8	0.66			0.87
Live-or-Dye 750/777								0.16	0.33			0.15
MitoSOX Red	0.71	0.11	0.95								0.95		0.63	0.13
MitoSpy Orange	0.83	0.13	0.66								0.81		0.93	0.16
MitoTracker Green	0.75	0.94	0.14				0.78				0.19		0.31	0.95
mKate	0.63	0.25	0.93				0.18				0.84	0.15	0.39	0.27
NL 493	0.85	0.93	0.31				0.82				0.36		0.43	0.95
NL 557	0.86	0.17	0.59								0.72		0.98	0.2
NL 637								0.98	0.59			0.99
NovaFluor Blue 510	0.58	0.98					0.99						0.13	0.97
NovaFluor Blue 530	0.71	0.89	0.12				0.68				0.16		0.27	0.9
NovaFluor Blue 555	0.92	0.77	0.31				0.64				0.41		0.61	0.79
NovaFluor Blue 585	0.97	0.54	0.71				0.47				0.8		0.78	0.56
NovaFluor Blue 610 / 30S	0.64	0.18	0.96				0.12				0.9		0.43	0.2
NovaFluor Blue 610 / 70S	0.65	0.25	0.95				0.23				0.89		0.41	0.27
NovaFluor Blue 660 / 120S	0.27	0.14	0.55				0.14	0.59	0.26		0.45	0.64	0.11	0.15
NovaFluor Blue 660 / 40S	0.2		0.44					0.76	0.34		0.36	0.8
NovaFluor Red 660								0.98	0.57			0.99
NovaFluor Red 685								0.81	0.69			0.88
NovaFluor Red 700								0.67	0.77			0.77
NovaFluor Red 710								0.63	0.96			0.68
NovaFluor Yellow 570	0.87	0.19	0.57								0.71		0.98	0.22
NovaFluor Yellow 590	0.75		0.86								0.97		0.71	0.13
NovaFluor Yellow 610	0.61		0.96								0.92		0.49
NovaFluor Yellow 660	0.12		0.3					0.9	0.4		0.25	0.92
NovaFluor Yellow 690	0.13		0.33					0.58	0.51		0.23	0.69
NovaFluor Yellow 730	0.15		0.26					0.34	0.67		0.23	0.34	0.11
NucView 488	0.81	0.83	0.24				0.61				0.3		0.42	0.85
PE-Alexa 610	0.44		0.94								0.79	0.14	0.29
PE-Alexa 700	0.25		0.37					0.13	0.27		0.33	0.15	0.25
PE-CF594	0.58		0.98								0.91		0.44
PE-Cy5	0.24		0.63					0.38	0.21		0.51	0.45	0.14
PE-Cy5.5	0.24		0.52					0.14	0.17		0.37	0.2	0.19
PE-Cy7
PE-Dazzle 594	0.74		0.92								0.93		0.69	0.13
PE-eFluor 610	0.69		0.92								0.96		0.61	0.11
PE-Fire 640	0.28		0.72					0.27	0.17		0.6	0.33	0.16
PE-Fire 700	0.14		0.41					0.26	0.37		0.27	0.33
PE-Fire 810	0.12		0.12										0.14
PerCP	0.17		0.53					0.2			0.42	0.26
PerCP-Cy5.5	0.16		0.51					0.28	0.3		0.36	0.35
PerCP-eFluor 710	0.11		0.34					0.26	0.43		0.24	0.3
PerCP-Vio700	0.13		0.42					0.24	0.36		0.29	0.29
PE-Texas Red	0.63		0.97								0.93		0.52
PE-Vio615	0.57		0.99								0.9		0.44
PE-Vio770
PI	0.57		0.96								0.89		0.45
Qdot 605	0.6		0.72								0.81		0.53
Qdot 655	0.23		0.61					0.2			0.54	0.23	0.12
Qdot 705	0.14		0.44					0.38	0.49		0.31	0.45
Qdot 800									0.2
Red 718								0.51	0.99			0.53
redFluor 710								0.59	0.95			0.66
RFP	0.84	0.13	0.71								0.84		0.91	0.16
Spark Blue 550	0.8	0.68	0.27				0.45				0.33		0.45	0.7
Spark NIR 685								0.8	0.67			0.87
Spark YG 570	0.86	0.2	0.47								0.62		0.99	0.23
Spark YG 581	0.83	0.14	0.54								0.71		0.97	0.17
Spark YG 593	0.74		0.9								0.96		0.69	0.12
SuperBright 600	0.67		0.94								1.0		0.57
SuperBright 645								0.99	0.6			0.99
SuperBright 702								0.63	0.9			0.71
SuperBright 780								0.13	0.29			0.13
Sytox Deep Red								0.88	0.54			0.93
Sytox Green	0.75	0.94	0.16				0.76				0.21		0.32	0.95
Sytox Orange	0.86	0.21	0.45				0.11				0.6		0.99	0.24
tdTomato	0.85	0.14	0.73								0.85		0.91	0.17
TMRE	0.84	0.13	0.62								0.77		0.95	0.17
TMRM	0.83	0.13	0.62								0.78		0.94	0.16
Venus	0.67	0.85					0.61				0.13		0.24	0.86
ViaKrome 561	0.86	0.17	0.57								0.7		0.98	0.2
ViaKrome 638								1.0	0.55			0.99
ViaKrome 808								0.43	0.86			0.41
Vio515	0.55	0.98					0.99						0.11	0.97
Vio667								0.98	0.59			0.99
VioBright 667								0.98	0.57			0.99
VioBright FITC	0.7	0.98	0.11				0.85				0.15		0.24	0.98
YFP	0.7	0.85	0.11				0.62				0.15		0.28	0.86
Zombie Green	0.63	1.0					0.92						0.17	1.0
Zombie NIR								0.29	0.59			0.25
Zombie Red	0.15		0.3					0.93	0.55		0.27	0.96

Preparing Spectra Viewer and Filter Coverage report....

Spectral Viewer - Spectral Flow Cytometry